Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cntn4Q69Z26 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cntn4Q69Z26 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cntn4Q69Z26 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cntn4Q69Z26 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cntn4Q69Z26 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cntn4Q69Z26 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cntn4Q69Z26 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cntn4Q69Z26 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cntn4Q69Z26 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cntn4Q69Z26 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cntn4Q69Z26 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cntn4Q69Z26 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cntn4Q69Z26 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cntn4Q69Z26 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cntn4Q69Z26 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cntn4Q69Z26 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cntn4Q69Z26 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cntn4Q69Z26 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cntn4Q69Z26 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cntn4Q69Z26 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cntn4Q69Z26 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cntn4Q69Z26 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms