Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp4Q68FH0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp4Q68FH0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp4Q68FH0 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp4Q68FH0 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp4Q68FH0 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp4Q68FH0 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp4Q68FH0 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp4Q68FH0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp4Q68FH0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp4Q68FH0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp4Q68FH0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp4Q68FH0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp4Q68FH0 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp4Q68FH0 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkp4Q68FH0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkp4Q68FH0 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkp4Q68FH0 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkp4Q68FH0 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkp4Q68FH0 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkp4Q68FH0 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkp4Q68FH0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkp4Q68FH0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkp4Q68FH0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkp4Q68FH0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkp4Q68FH0 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkp4Q68FH0 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkp4Q68FH0 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkp4Q68FH0 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkp4Q68FH0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkp4Q68FH0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkp4Q68FH0 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkp4Q68FH0 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkp4Q68FH0 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkp4Q68FH0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkp4Q68FH0 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms