Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD7

Fnip1, Folliculin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fnip1Q68FD7 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fnip1Q68FD7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fnip1Q68FD7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fnip1Q68FD7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fnip1Q68FD7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fnip1Q68FD7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fnip1Q68FD7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fnip1Q68FD7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fnip1Q68FD7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fnip1Q68FD7 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Fnip1Q68FD7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fnip1Q68FD7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fnip1Q68FD7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fnip1Q68FD7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fnip1Q68FD7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fnip1Q68FD7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fnip1Q68FD7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fnip1Q68FD7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fnip1Q68FD7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fnip1Q68FD7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fnip1Q68FD7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fnip1Q68FD7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fnip1Q68FD7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fnip1Q68FD7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fnip1Q68FD7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fnip1Q68FD7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fnip1Q68FD7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fnip1Q68FD7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fnip1Q68FD7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fnip1Q68FD7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Fnip1Q68FD7 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fnip1Q68FD7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fnip1Q68FD7 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fnip1Q68FD7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fnip1Q68FD7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fnip1Q68FD7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fnip1Q68FD7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fnip1Q68FD7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fnip1Q68FD7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Fnip1Q68FD7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fnip1Q68FD7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fnip1Q68FD7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fnip1Q68FD7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fnip1Q68FD7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fnip1Q68FD7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Fnip1Q68FD7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Fnip1Q68FD7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms