Protein–RNA interactions for Protein: Q66K08

Cilp, Cartilage intermediate layer protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CilpQ66K08 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CilpQ66K08 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CilpQ66K08 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CilpQ66K08 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CilpQ66K08 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CilpQ66K08 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CilpQ66K08 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CilpQ66K08 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CilpQ66K08 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CilpQ66K08 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CilpQ66K08 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CilpQ66K08 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CilpQ66K08 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CilpQ66K08 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CilpQ66K08 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CilpQ66K08 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CilpQ66K08 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CilpQ66K08 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CilpQ66K08 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CilpQ66K08 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CilpQ66K08 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CilpQ66K08 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CilpQ66K08 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CilpQ66K08 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CilpQ66K08 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CilpQ66K08 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CilpQ66K08 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CilpQ66K08 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CilpQ66K08 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CilpQ66K08 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CilpQ66K08 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CilpQ66K08 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CilpQ66K08 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CilpQ66K08 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CilpQ66K08 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CilpQ66K08 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CilpQ66K08 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CilpQ66K08 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CilpQ66K08 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CilpQ66K08 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CilpQ66K08 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CilpQ66K08 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CilpQ66K08 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CilpQ66K08 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CilpQ66K08 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CilpQ66K08 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CilpQ66K08 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CilpQ66K08 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CilpQ66K08 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CilpQ66K08 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CilpQ66K08 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CilpQ66K08 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CilpQ66K08 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CilpQ66K08 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CilpQ66K08 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CilpQ66K08 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CilpQ66K08 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms