Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Top2bQ64511 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Top2bQ64511 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Top2bQ64511 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Top2bQ64511 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Top2bQ64511 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Top2bQ64511 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Top2bQ64511 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Top2bQ64511 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Top2bQ64511 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Top2bQ64511 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Top2bQ64511 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Top2bQ64511 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Top2bQ64511 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Top2bQ64511 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Top2bQ64511 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Top2bQ64511 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Top2bQ64511 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Top2bQ64511 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Top2bQ64511 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Top2bQ64511 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Top2bQ64511 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Top2bQ64511 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Top2bQ64511 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Top2bQ64511 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Top2bQ64511 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Top2bQ64511 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Top2bQ64511 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Top2bQ64511 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Top2bQ64511 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Top2bQ64511 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Top2bQ64511 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Top2bQ64511 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Top2bQ64511 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Top2bQ64511 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Top2bQ64511 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Top2bQ64511 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Top2bQ64511 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Top2bQ64511 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Top2bQ64511 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Top2bQ64511 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Top2bQ64511 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Top2bQ64511 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Top2bQ64511 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Top2bQ64511 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Top2bQ64511 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Top2bQ64511 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Top2bQ64511 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Top2bQ64511 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Top2bQ64511 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Top2bQ64511 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Top2bQ64511 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Top2bQ64511 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Top2bQ64511 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Top2bQ64511 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Top2bQ64511 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Top2bQ64511 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Top2bQ64511 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Top2bQ64511 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Top2bQ64511 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Top2bQ64511 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Top2bQ64511 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Top2bQ64511 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Top2bQ64511 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Top2bQ64511 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Top2bQ64511 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Top2bQ64511 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Top2bQ64511 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Top2bQ64511 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Top2bQ64511 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Top2bQ64511 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Top2bQ64511 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Top2bQ64511 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Top2bQ64511 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Top2bQ64511 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Top2bQ64511 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Top2bQ64511 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Top2bQ64511 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Top2bQ64511 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Top2bQ64511 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Top2bQ64511 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Top2bQ64511 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Top2bQ64511 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Top2bQ64511 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Top2bQ64511 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Top2bQ64511 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Top2bQ64511 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Top2bQ64511 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Top2bQ64511 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Top2bQ64511 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Top2bQ64511 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Top2bQ64511 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Top2bQ64511 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Top2bQ64511 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Top2bQ64511 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Top2bQ64511 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Top2bQ64511 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Top2bQ64511 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Top2bQ64511 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Top2bQ64511 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms