Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprdQ64487 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PtprdQ64487 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms