Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

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Length 994 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clcn1Q64347 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clcn1Q64347 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clcn1Q64347 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clcn1Q64347 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clcn1Q64347 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Clcn1Q64347 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
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Clcn1Q64347 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clcn1Q64347 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clcn1Q64347 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clcn1Q64347 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clcn1Q64347 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Clcn1Q64347 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clcn1Q64347 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clcn1Q64347 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clcn1Q64347 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clcn1Q64347 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clcn1Q64347 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clcn1Q64347 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clcn1Q64347 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clcn1Q64347 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clcn1Q64347 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clcn1Q64347 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clcn1Q64347 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clcn1Q64347 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clcn1Q64347 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
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Clcn1Q64347 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clcn1Q64347 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clcn1Q64347 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clcn1Q64347 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clcn1Q64347 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clcn1Q64347 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clcn1Q64347 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clcn1Q64347 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
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Clcn1Q64347 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
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Clcn1Q64347 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
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Clcn1Q64347 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
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Clcn1Q64347 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
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Clcn1Q64347 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Clcn1Q64347 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
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Clcn1Q64347 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clcn1Q64347 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
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Clcn1Q64347 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
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Clcn1Q64347 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clcn1Q64347 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
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Clcn1Q64347 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clcn1Q64347 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Clcn1Q64347 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Clcn1Q64347 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clcn1Q64347 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clcn1Q64347 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clcn1Q64347 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clcn1Q64347 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clcn1Q64347 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clcn1Q64347 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clcn1Q64347 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clcn1Q64347 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clcn1Q64347 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
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Clcn1Q64347 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clcn1Q64347 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
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