Protein–RNA interactions for Protein: Q64253

Ly6e, Lymphocyte antigen 6E, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6eQ64253 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ly6eQ64253 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6eQ64253 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6eQ64253 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6eQ64253 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6eQ64253 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6eQ64253 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6eQ64253 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6eQ64253 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6eQ64253 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6eQ64253 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6eQ64253 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6eQ64253 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6eQ64253 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6eQ64253 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6eQ64253 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6eQ64253 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6eQ64253 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6eQ64253 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6eQ64253 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6eQ64253 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6eQ64253 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6eQ64253 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6eQ64253 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6eQ64253 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6eQ64253 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6eQ64253 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6eQ64253 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6eQ64253 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6eQ64253 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6eQ64253 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6eQ64253 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6eQ64253 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6eQ64253 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6eQ64253 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6eQ64253 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6eQ64253 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6eQ64253 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6eQ64253 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6eQ64253 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6eQ64253 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6eQ64253 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6eQ64253 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6eQ64253 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6eQ64253 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6eQ64253 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6eQ64253 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6eQ64253 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6eQ64253 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6eQ64253 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6eQ64253 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6eQ64253 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6eQ64253 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6eQ64253 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6eQ64253 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ly6eQ64253 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ly6eQ64253 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ly6eQ64253 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ly6eQ64253 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ly6eQ64253 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ly6eQ64253 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ly6eQ64253 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ly6eQ64253 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ly6eQ64253 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ly6eQ64253 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ly6eQ64253 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ly6eQ64253 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ly6eQ64253 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ly6eQ64253 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ly6eQ64253 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ly6eQ64253 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ly6eQ64253 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ly6eQ64253 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ly6eQ64253 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ly6eQ64253 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ly6eQ64253 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ly6eQ64253 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ly6eQ64253 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ly6eQ64253 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ly6eQ64253 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ly6eQ64253 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ly6eQ64253 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ly6eQ64253 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ly6eQ64253 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ly6eQ64253 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ly6eQ64253 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ly6eQ64253 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ly6eQ64253 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ly6eQ64253 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ly6eQ64253 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ly6eQ64253 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ly6eQ64253 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ly6eQ64253 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ly6eQ64253 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ly6eQ64253 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms