Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pan3Q640Q5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pan3Q640Q5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pan3Q640Q5 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pan3Q640Q5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pan3Q640Q5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pan3Q640Q5 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pan3Q640Q5 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pan3Q640Q5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pan3Q640Q5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pan3Q640Q5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pan3Q640Q5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pan3Q640Q5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pan3Q640Q5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pan3Q640Q5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pan3Q640Q5 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pan3Q640Q5 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pan3Q640Q5 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pan3Q640Q5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pan3Q640Q5 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pan3Q640Q5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pan3Q640Q5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pan3Q640Q5 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pan3Q640Q5 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pan3Q640Q5 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pan3Q640Q5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pan3Q640Q5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pan3Q640Q5 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pan3Q640Q5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pan3Q640Q5 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pan3Q640Q5 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pan3Q640Q5 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pan3Q640Q5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pan3Q640Q5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pan3Q640Q5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pan3Q640Q5 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pan3Q640Q5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pan3Q640Q5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pan3Q640Q5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pan3Q640Q5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pan3Q640Q5 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pan3Q640Q5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pan3Q640Q5 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pan3Q640Q5 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pan3Q640Q5 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pan3Q640Q5 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pan3Q640Q5 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pan3Q640Q5 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pan3Q640Q5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pan3Q640Q5 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pan3Q640Q5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pan3Q640Q5 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pan3Q640Q5 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pan3Q640Q5 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pan3Q640Q5 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pan3Q640Q5 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pan3Q640Q5 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pan3Q640Q5 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pan3Q640Q5 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pan3Q640Q5 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pan3Q640Q5 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pan3Q640Q5 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pan3Q640Q5 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pan3Q640Q5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pan3Q640Q5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pan3Q640Q5 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pan3Q640Q5 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Pan3Q640Q5 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pan3Q640Q5 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pan3Q640Q5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pan3Q640Q5 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pan3Q640Q5 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pan3Q640Q5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pan3Q640Q5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pan3Q640Q5 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pan3Q640Q5 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pan3Q640Q5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pan3Q640Q5 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pan3Q640Q5 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pan3Q640Q5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pan3Q640Q5 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pan3Q640Q5 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pan3Q640Q5 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pan3Q640Q5 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pan3Q640Q5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pan3Q640Q5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pan3Q640Q5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pan3Q640Q5 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pan3Q640Q5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pan3Q640Q5 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pan3Q640Q5 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pan3Q640Q5 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pan3Q640Q5 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pan3Q640Q5 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pan3Q640Q5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pan3Q640Q5 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pan3Q640Q5 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pan3Q640Q5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pan3Q640Q5 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms