Protein–RNA interactions for Protein: Q62471

Lcn3, Vomeronasal secretory protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn3Q62471 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Lcn3Q62471 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lcn3Q62471 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lcn3Q62471 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lcn3Q62471 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lcn3Q62471 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lcn3Q62471 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lcn3Q62471 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lcn3Q62471 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lcn3Q62471 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lcn3Q62471 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lcn3Q62471 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lcn3Q62471 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Lcn3Q62471 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Lcn3Q62471 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lcn3Q62471 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lcn3Q62471 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lcn3Q62471 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lcn3Q62471 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lcn3Q62471 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Lcn3Q62471 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lcn3Q62471 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lcn3Q62471 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lcn3Q62471 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lcn3Q62471 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lcn3Q62471 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lcn3Q62471 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lcn3Q62471 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Lcn3Q62471 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lcn3Q62471 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lcn3Q62471 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Lcn3Q62471 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lcn3Q62471 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lcn3Q62471 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Lcn3Q62471 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lcn3Q62471 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lcn3Q62471 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Lcn3Q62471 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Lcn3Q62471 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Lcn3Q62471 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lcn3Q62471 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lcn3Q62471 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lcn3Q62471 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lcn3Q62471 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lcn3Q62471 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lcn3Q62471 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lcn3Q62471 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lcn3Q62471 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lcn3Q62471 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lcn3Q62471 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lcn3Q62471 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lcn3Q62471 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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