Protein–RNA interactions for Protein: Q62445

Sp4, Transcription factor Sp4, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp4Q62445 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sp4Q62445 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sp4Q62445 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sp4Q62445 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sp4Q62445 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sp4Q62445 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sp4Q62445 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sp4Q62445 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sp4Q62445 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sp4Q62445 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sp4Q62445 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sp4Q62445 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sp4Q62445 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sp4Q62445 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sp4Q62445 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sp4Q62445 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sp4Q62445 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sp4Q62445 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sp4Q62445 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sp4Q62445 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sp4Q62445 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sp4Q62445 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sp4Q62445 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sp4Q62445 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sp4Q62445 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sp4Q62445 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sp4Q62445 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sp4Q62445 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sp4Q62445 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sp4Q62445 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sp4Q62445 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sp4Q62445 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sp4Q62445 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sp4Q62445 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Sp4Q62445 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Sp4Q62445 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sp4Q62445 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sp4Q62445 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sp4Q62445 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sp4Q62445 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sp4Q62445 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sp4Q62445 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sp4Q62445 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sp4Q62445 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Sp4Q62445 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sp4Q62445 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sp4Q62445 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Sp4Q62445 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Sp4Q62445 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sp4Q62445 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sp4Q62445 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sp4Q62445 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sp4Q62445 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Sp4Q62445 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sp4Q62445 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sp4Q62445 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sp4Q62445 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Sp4Q62445 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sp4Q62445 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sp4Q62445 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sp4Q62445 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sp4Q62445 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sp4Q62445 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sp4Q62445 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sp4Q62445 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sp4Q62445 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sp4Q62445 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sp4Q62445 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sp4Q62445 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sp4Q62445 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sp4Q62445 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sp4Q62445 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sp4Q62445 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sp4Q62445 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sp4Q62445 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sp4Q62445 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sp4Q62445 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sp4Q62445 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sp4Q62445 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sp4Q62445 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sp4Q62445 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sp4Q62445 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sp4Q62445 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sp4Q62445 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sp4Q62445 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sp4Q62445 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Sp4Q62445 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sp4Q62445 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sp4Q62445 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sp4Q62445 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sp4Q62445 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sp4Q62445 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sp4Q62445 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sp4Q62445 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Sp4Q62445 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sp4Q62445 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sp4Q62445 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sp4Q62445 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sp4Q62445 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sp4Q62445 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms