Protein–RNA interactions for Protein: Q62388

Atm, Serine-protein kinase ATM, mousemouse

Predictions only

Length 3,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtmQ62388 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
AtmQ62388 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AtmQ62388 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AtmQ62388 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AtmQ62388 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AtmQ62388 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AtmQ62388 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AtmQ62388 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AtmQ62388 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AtmQ62388 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AtmQ62388 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AtmQ62388 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AtmQ62388 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AtmQ62388 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AtmQ62388 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AtmQ62388 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AtmQ62388 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AtmQ62388 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AtmQ62388 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AtmQ62388 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AtmQ62388 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AtmQ62388 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AtmQ62388 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AtmQ62388 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AtmQ62388 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AtmQ62388 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AtmQ62388 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AtmQ62388 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AtmQ62388 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AtmQ62388 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AtmQ62388 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AtmQ62388 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AtmQ62388 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AtmQ62388 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AtmQ62388 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AtmQ62388 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AtmQ62388 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AtmQ62388 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AtmQ62388 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AtmQ62388 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AtmQ62388 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AtmQ62388 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AtmQ62388 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AtmQ62388 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AtmQ62388 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AtmQ62388 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
AtmQ62388 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AtmQ62388 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AtmQ62388 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AtmQ62388 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AtmQ62388 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AtmQ62388 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
AtmQ62388 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AtmQ62388 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
AtmQ62388 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AtmQ62388 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AtmQ62388 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AtmQ62388 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AtmQ62388 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AtmQ62388 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AtmQ62388 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AtmQ62388 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AtmQ62388 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AtmQ62388 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AtmQ62388 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AtmQ62388 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AtmQ62388 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AtmQ62388 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AtmQ62388 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
AtmQ62388 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AtmQ62388 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AtmQ62388 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AtmQ62388 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AtmQ62388 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AtmQ62388 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms