Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Taf6Q62311 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf6Q62311 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms