Protein–RNA interactions for Protein: Q62288

Spock1, Testican-1, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spock1Q62288 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spock1Q62288 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Spock1Q62288 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Spock1Q62288 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Spock1Q62288 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Spock1Q62288 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Spock1Q62288 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Spock1Q62288 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Spock1Q62288 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spock1Q62288 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spock1Q62288 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Spock1Q62288 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spock1Q62288 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spock1Q62288 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spock1Q62288 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spock1Q62288 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spock1Q62288 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spock1Q62288 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spock1Q62288 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spock1Q62288 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Spock1Q62288 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Spock1Q62288 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spock1Q62288 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Spock1Q62288 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spock1Q62288 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spock1Q62288 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spock1Q62288 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spock1Q62288 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spock1Q62288 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spock1Q62288 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spock1Q62288 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spock1Q62288 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Spock1Q62288 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spock1Q62288 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spock1Q62288 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spock1Q62288 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spock1Q62288 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spock1Q62288 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Spock1Q62288 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms