Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sema3cQ62181 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sema3cQ62181 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms