Protein–RNA interactions for Protein: Q62147

Sspn, Sarcospan, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SspnQ62147 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SspnQ62147 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SspnQ62147 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SspnQ62147 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SspnQ62147 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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