Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf1Q61999 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Odf1Q61999 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Odf1Q61999 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Odf1Q61999 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Odf1Q61999 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Odf1Q61999 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Odf1Q61999 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Odf1Q61999 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Odf1Q61999 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Odf1Q61999 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Odf1Q61999 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Odf1Q61999 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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Odf1Q61999 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Odf1Q61999 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Odf1Q61999 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Odf1Q61999 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Odf1Q61999 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Odf1Q61999 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Odf1Q61999 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Odf1Q61999 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Odf1Q61999 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Odf1Q61999 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Odf1Q61999 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf1Q61999 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf1Q61999 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf1Q61999 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf1Q61999 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf1Q61999 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf1Q61999 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf1Q61999 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf1Q61999 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf1Q61999 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Odf1Q61999 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf1Q61999 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf1Q61999 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf1Q61999 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf1Q61999 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf1Q61999 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf1Q61999 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Odf1Q61999 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Odf1Q61999 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Odf1Q61999 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Odf1Q61999 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Odf1Q61999 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Odf1Q61999 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Odf1Q61999 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Odf1Q61999 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Odf1Q61999 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Odf1Q61999 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Odf1Q61999 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Odf1Q61999 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Odf1Q61999 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Odf1Q61999 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Odf1Q61999 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Odf1Q61999 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Odf1Q61999 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Odf1Q61999 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Odf1Q61999 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Odf1Q61999 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Odf1Q61999 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Odf1Q61999 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Odf1Q61999 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Odf1Q61999 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Odf1Q61999 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Odf1Q61999 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Odf1Q61999 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Odf1Q61999 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Odf1Q61999 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Odf1Q61999 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Odf1Q61999 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Odf1Q61999 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Odf1Q61999 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Odf1Q61999 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Odf1Q61999 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Odf1Q61999 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Odf1Q61999 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Odf1Q61999 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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