Protein–RNA interactions for Protein: Q61990

Pcbp2, Poly(rC)-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp2Q61990 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pcbp2Q61990 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pcbp2Q61990 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pcbp2Q61990 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pcbp2Q61990 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Pcbp2Q61990 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pcbp2Q61990 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pcbp2Q61990 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Pcbp2Q61990 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pcbp2Q61990 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pcbp2Q61990 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pcbp2Q61990 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pcbp2Q61990 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pcbp2Q61990 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pcbp2Q61990 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pcbp2Q61990 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pcbp2Q61990 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pcbp2Q61990 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pcbp2Q61990 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pcbp2Q61990 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pcbp2Q61990 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pcbp2Q61990 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pcbp2Q61990 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pcbp2Q61990 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pcbp2Q61990 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pcbp2Q61990 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pcbp2Q61990 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pcbp2Q61990 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pcbp2Q61990 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pcbp2Q61990 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pcbp2Q61990 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pcbp2Q61990 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pcbp2Q61990 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pcbp2Q61990 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pcbp2Q61990 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pcbp2Q61990 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pcbp2Q61990 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pcbp2Q61990 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Pcbp2Q61990 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Pcbp2Q61990 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pcbp2Q61990 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pcbp2Q61990 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pcbp2Q61990 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pcbp2Q61990 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Pcbp2Q61990 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pcbp2Q61990 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pcbp2Q61990 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pcbp2Q61990 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pcbp2Q61990 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pcbp2Q61990 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pcbp2Q61990 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pcbp2Q61990 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pcbp2Q61990 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pcbp2Q61990 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pcbp2Q61990 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pcbp2Q61990 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Pcbp2Q61990 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pcbp2Q61990 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pcbp2Q61990 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Pcbp2Q61990 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pcbp2Q61990 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pcbp2Q61990 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pcbp2Q61990 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pcbp2Q61990 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pcbp2Q61990 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pcbp2Q61990 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pcbp2Q61990 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pcbp2Q61990 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pcbp2Q61990 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pcbp2Q61990 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pcbp2Q61990 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pcbp2Q61990 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pcbp2Q61990 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pcbp2Q61990 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pcbp2Q61990 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pcbp2Q61990 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pcbp2Q61990 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pcbp2Q61990 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pcbp2Q61990 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pcbp2Q61990 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pcbp2Q61990 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pcbp2Q61990 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pcbp2Q61990 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pcbp2Q61990 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pcbp2Q61990 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pcbp2Q61990 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pcbp2Q61990 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pcbp2Q61990 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pcbp2Q61990 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pcbp2Q61990 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pcbp2Q61990 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pcbp2Q61990 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pcbp2Q61990 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pcbp2Q61990 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Pcbp2Q61990 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pcbp2Q61990 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Pcbp2Q61990 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pcbp2Q61990 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pcbp2Q61990 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pcbp2Q61990 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms