Protein–RNA interactions for Protein: Q61878

Prg2, Bone marrow proteoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg2Q61878 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prg2Q61878 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Prg2Q61878 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Prg2Q61878 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Prg2Q61878 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prg2Q61878 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prg2Q61878 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Prg2Q61878 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prg2Q61878 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prg2Q61878 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prg2Q61878 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prg2Q61878 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prg2Q61878 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prg2Q61878 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prg2Q61878 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prg2Q61878 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prg2Q61878 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prg2Q61878 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prg2Q61878 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prg2Q61878 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prg2Q61878 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prg2Q61878 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prg2Q61878 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prg2Q61878 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prg2Q61878 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prg2Q61878 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prg2Q61878 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prg2Q61878 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Prg2Q61878 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prg2Q61878 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prg2Q61878 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prg2Q61878 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prg2Q61878 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prg2Q61878 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prg2Q61878 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prg2Q61878 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prg2Q61878 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prg2Q61878 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prg2Q61878 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prg2Q61878 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Prg2Q61878 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Prg2Q61878 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prg2Q61878 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prg2Q61878 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prg2Q61878 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prg2Q61878 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prg2Q61878 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prg2Q61878 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prg2Q61878 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prg2Q61878 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prg2Q61878 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prg2Q61878 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prg2Q61878 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prg2Q61878 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prg2Q61878 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prg2Q61878 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prg2Q61878 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prg2Q61878 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prg2Q61878 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prg2Q61878 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prg2Q61878 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prg2Q61878 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Prg2Q61878 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prg2Q61878 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Prg2Q61878 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prg2Q61878 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms