Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itga6Q61739 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itga6Q61739 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itga6Q61739 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Itga6Q61739 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itga6Q61739 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itga6Q61739 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itga6Q61739 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Itga6Q61739 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Itga6Q61739 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itga6Q61739 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itga6Q61739 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itga6Q61739 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itga6Q61739 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itga6Q61739 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itga6Q61739 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Itga6Q61739 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itga6Q61739 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itga6Q61739 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itga6Q61739 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itga6Q61739 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Itga6Q61739 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itga6Q61739 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Itga6Q61739 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Itga6Q61739 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Itga6Q61739 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Itga6Q61739 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Itga6Q61739 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Itga6Q61739 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Itga6Q61739 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Itga6Q61739 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itga6Q61739 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms