Protein–RNA interactions for Protein: Q61539

Esrrb, Steroid hormone receptor ERR2, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EsrrbQ61539 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EsrrbQ61539 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EsrrbQ61539 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EsrrbQ61539 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EsrrbQ61539 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EsrrbQ61539 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EsrrbQ61539 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EsrrbQ61539 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EsrrbQ61539 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EsrrbQ61539 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EsrrbQ61539 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
EsrrbQ61539 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EsrrbQ61539 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EsrrbQ61539 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EsrrbQ61539 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EsrrbQ61539 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EsrrbQ61539 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EsrrbQ61539 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EsrrbQ61539 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EsrrbQ61539 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EsrrbQ61539 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EsrrbQ61539 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EsrrbQ61539 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EsrrbQ61539 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
EsrrbQ61539 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EsrrbQ61539 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
EsrrbQ61539 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
EsrrbQ61539 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EsrrbQ61539 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EsrrbQ61539 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EsrrbQ61539 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EsrrbQ61539 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EsrrbQ61539 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EsrrbQ61539 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EsrrbQ61539 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EsrrbQ61539 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EsrrbQ61539 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EsrrbQ61539 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EsrrbQ61539 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EsrrbQ61539 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EsrrbQ61539 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
EsrrbQ61539 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
EsrrbQ61539 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
EsrrbQ61539 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EsrrbQ61539 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EsrrbQ61539 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EsrrbQ61539 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EsrrbQ61539 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EsrrbQ61539 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
EsrrbQ61539 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EsrrbQ61539 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EsrrbQ61539 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EsrrbQ61539 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EsrrbQ61539 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EsrrbQ61539 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EsrrbQ61539 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EsrrbQ61539 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EsrrbQ61539 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EsrrbQ61539 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EsrrbQ61539 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EsrrbQ61539 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
EsrrbQ61539 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EsrrbQ61539 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EsrrbQ61539 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EsrrbQ61539 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EsrrbQ61539 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EsrrbQ61539 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EsrrbQ61539 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
EsrrbQ61539 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EsrrbQ61539 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EsrrbQ61539 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EsrrbQ61539 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EsrrbQ61539 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EsrrbQ61539 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
EsrrbQ61539 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EsrrbQ61539 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EsrrbQ61539 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EsrrbQ61539 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EsrrbQ61539 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EsrrbQ61539 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EsrrbQ61539 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EsrrbQ61539 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EsrrbQ61539 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
EsrrbQ61539 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
EsrrbQ61539 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EsrrbQ61539 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
EsrrbQ61539 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EsrrbQ61539 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EsrrbQ61539 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EsrrbQ61539 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EsrrbQ61539 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EsrrbQ61539 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EsrrbQ61539 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EsrrbQ61539 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EsrrbQ61539 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EsrrbQ61539 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EsrrbQ61539 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EsrrbQ61539 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EsrrbQ61539 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EsrrbQ61539 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms