Protein–RNA interactions for Protein: Q61501

E2f1, Transcription factor E2F1, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f1Q61501 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2f1Q61501 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2f1Q61501 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2f1Q61501 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
E2f1Q61501 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2f1Q61501 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2f1Q61501 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2f1Q61501 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2f1Q61501 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2f1Q61501 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2f1Q61501 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2f1Q61501 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2f1Q61501 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2f1Q61501 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2f1Q61501 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
E2f1Q61501 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2f1Q61501 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2f1Q61501 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2f1Q61501 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2f1Q61501 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2f1Q61501 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2f1Q61501 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2f1Q61501 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2f1Q61501 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2f1Q61501 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2f1Q61501 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2f1Q61501 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2f1Q61501 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2f1Q61501 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
E2f1Q61501 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2f1Q61501 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
E2f1Q61501 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2f1Q61501 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2f1Q61501 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2f1Q61501 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2f1Q61501 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2f1Q61501 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2f1Q61501 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2f1Q61501 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2f1Q61501 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2f1Q61501 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E2f1Q61501 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2f1Q61501 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2f1Q61501 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2f1Q61501 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2f1Q61501 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2f1Q61501 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2f1Q61501 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2f1Q61501 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2f1Q61501 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2f1Q61501 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2f1Q61501 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
E2f1Q61501 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E2f1Q61501 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2f1Q61501 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2f1Q61501 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2f1Q61501 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2f1Q61501 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2f1Q61501 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2f1Q61501 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2f1Q61501 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2f1Q61501 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2f1Q61501 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2f1Q61501 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
E2f1Q61501 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2f1Q61501 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
E2f1Q61501 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
E2f1Q61501 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2f1Q61501 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E2f1Q61501 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
E2f1Q61501 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2f1Q61501 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2f1Q61501 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2f1Q61501 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2f1Q61501 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2f1Q61501 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2f1Q61501 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2f1Q61501 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2f1Q61501 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2f1Q61501 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2f1Q61501 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2f1Q61501 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2f1Q61501 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2f1Q61501 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
E2f1Q61501 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2f1Q61501 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2f1Q61501 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2f1Q61501 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2f1Q61501 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2f1Q61501 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2f1Q61501 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2f1Q61501 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2f1Q61501 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2f1Q61501 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2f1Q61501 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
E2f1Q61501 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2f1Q61501 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2f1Q61501 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2f1Q61501 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
E2f1Q61501 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms