Protein–RNA interactions for Protein: Q61500

Itm2a, Integral membrane protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itm2aQ61500 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itm2aQ61500 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itm2aQ61500 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itm2aQ61500 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itm2aQ61500 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itm2aQ61500 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itm2aQ61500 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itm2aQ61500 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itm2aQ61500 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itm2aQ61500 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itm2aQ61500 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itm2aQ61500 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itm2aQ61500 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itm2aQ61500 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itm2aQ61500 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itm2aQ61500 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itm2aQ61500 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itm2aQ61500 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itm2aQ61500 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itm2aQ61500 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Itm2aQ61500 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itm2aQ61500 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itm2aQ61500 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itm2aQ61500 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itm2aQ61500 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itm2aQ61500 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itm2aQ61500 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itm2aQ61500 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itm2aQ61500 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itm2aQ61500 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itm2aQ61500 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itm2aQ61500 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itm2aQ61500 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Itm2aQ61500 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Itm2aQ61500 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itm2aQ61500 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itm2aQ61500 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itm2aQ61500 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itm2aQ61500 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itm2aQ61500 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itm2aQ61500 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itm2aQ61500 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itm2aQ61500 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Itm2aQ61500 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Itm2aQ61500 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itm2aQ61500 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itm2aQ61500 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itm2aQ61500 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itm2aQ61500 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itm2aQ61500 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itm2aQ61500 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itm2aQ61500 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Itm2aQ61500 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itm2aQ61500 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itm2aQ61500 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itm2aQ61500 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itm2aQ61500 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itm2aQ61500 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itm2aQ61500 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itm2aQ61500 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itm2aQ61500 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itm2aQ61500 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itm2aQ61500 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itm2aQ61500 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itm2aQ61500 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itm2aQ61500 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itm2aQ61500 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itm2aQ61500 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itm2aQ61500 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Itm2aQ61500 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itm2aQ61500 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itm2aQ61500 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itm2aQ61500 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itm2aQ61500 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itm2aQ61500 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itm2aQ61500 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itm2aQ61500 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itm2aQ61500 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itm2aQ61500 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itm2aQ61500 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itm2aQ61500 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itm2aQ61500 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Itm2aQ61500 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Itm2aQ61500 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itm2aQ61500 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itm2aQ61500 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itm2aQ61500 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itm2aQ61500 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itm2aQ61500 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itm2aQ61500 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itm2aQ61500 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itm2aQ61500 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itm2aQ61500 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itm2aQ61500 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itm2aQ61500 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itm2aQ61500 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Itm2aQ61500 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itm2aQ61500 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itm2aQ61500 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itm2aQ61500 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms