Protein–RNA interactions for Protein: Q61475

Cd55, Complement decay-accelerating factor, GPI-anchored, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd55Q61475 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd55Q61475 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd55Q61475 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd55Q61475 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd55Q61475 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd55Q61475 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd55Q61475 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd55Q61475 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd55Q61475 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd55Q61475 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd55Q61475 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd55Q61475 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd55Q61475 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd55Q61475 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd55Q61475 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd55Q61475 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd55Q61475 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd55Q61475 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd55Q61475 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd55Q61475 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd55Q61475 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd55Q61475 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd55Q61475 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd55Q61475 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd55Q61475 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd55Q61475 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd55Q61475 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd55Q61475 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd55Q61475 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd55Q61475 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd55Q61475 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd55Q61475 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd55Q61475 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd55Q61475 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd55Q61475 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd55Q61475 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd55Q61475 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd55Q61475 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd55Q61475 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd55Q61475 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd55Q61475 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd55Q61475 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd55Q61475 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd55Q61475 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd55Q61475 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd55Q61475 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd55Q61475 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd55Q61475 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cd55Q61475 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd55Q61475 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms