Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Msi1Q61474 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms