Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccne1Q61457 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccne1Q61457 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccne1Q61457 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccne1Q61457 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccne1Q61457 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccne1Q61457 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccne1Q61457 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccne1Q61457 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccne1Q61457 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccne1Q61457 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccne1Q61457 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccne1Q61457 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccne1Q61457 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccne1Q61457 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccne1Q61457 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccne1Q61457 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccne1Q61457 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccne1Q61457 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccne1Q61457 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccne1Q61457 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccne1Q61457 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccne1Q61457 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccne1Q61457 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccne1Q61457 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccne1Q61457 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccne1Q61457 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccne1Q61457 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccne1Q61457 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccne1Q61457 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccne1Q61457 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccne1Q61457 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccne1Q61457 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccne1Q61457 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccne1Q61457 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccne1Q61457 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccne1Q61457 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccne1Q61457 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccne1Q61457 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccne1Q61457 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccne1Q61457 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccne1Q61457 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccne1Q61457 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccne1Q61457 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccne1Q61457 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccne1Q61457 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccne1Q61457 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccne1Q61457 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccne1Q61457 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccne1Q61457 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccne1Q61457 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccne1Q61457 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccne1Q61457 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccne1Q61457 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccne1Q61457 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccne1Q61457 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccne1Q61457 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccne1Q61457 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccne1Q61457 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccne1Q61457 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccne1Q61457 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccne1Q61457 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccne1Q61457 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccne1Q61457 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccne1Q61457 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccne1Q61457 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccne1Q61457 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccne1Q61457 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccne1Q61457 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccne1Q61457 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccne1Q61457 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccne1Q61457 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccne1Q61457 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccne1Q61457 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccne1Q61457 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccne1Q61457 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccne1Q61457 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccne1Q61457 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccne1Q61457 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccne1Q61457 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccne1Q61457 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccne1Q61457 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccne1Q61457 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccne1Q61457 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccne1Q61457 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccne1Q61457 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccne1Q61457 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccne1Q61457 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccne1Q61457 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccne1Q61457 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccne1Q61457 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccne1Q61457 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccne1Q61457 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccne1Q61457 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccne1Q61457 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccne1Q61457 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccne1Q61457 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccne1Q61457 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccne1Q61457 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccne1Q61457 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms