Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PcolceQ61398 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms