Protein–RNA interactions for Protein: Q61313

Tfap2b, Transcription factor AP-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2bQ61313 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tfap2bQ61313 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tfap2bQ61313 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tfap2bQ61313 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tfap2bQ61313 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tfap2bQ61313 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tfap2bQ61313 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tfap2bQ61313 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tfap2bQ61313 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tfap2bQ61313 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tfap2bQ61313 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tfap2bQ61313 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tfap2bQ61313 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tfap2bQ61313 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tfap2bQ61313 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tfap2bQ61313 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tfap2bQ61313 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tfap2bQ61313 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tfap2bQ61313 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tfap2bQ61313 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tfap2bQ61313 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tfap2bQ61313 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tfap2bQ61313 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tfap2bQ61313 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tfap2bQ61313 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tfap2bQ61313 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tfap2bQ61313 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tfap2bQ61313 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tfap2bQ61313 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tfap2bQ61313 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tfap2bQ61313 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tfap2bQ61313 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tfap2bQ61313 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms