Protein–RNA interactions for Protein: Q61301

Ctnna2, Catenin alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna2Q61301 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctnna2Q61301 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ctnna2Q61301 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ctnna2Q61301 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ctnna2Q61301 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ctnna2Q61301 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ctnna2Q61301 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnna2Q61301 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnna2Q61301 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnna2Q61301 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnna2Q61301 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnna2Q61301 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnna2Q61301 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnna2Q61301 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnna2Q61301 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnna2Q61301 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnna2Q61301 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnna2Q61301 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnna2Q61301 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnna2Q61301 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnna2Q61301 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnna2Q61301 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnna2Q61301 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnna2Q61301 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnna2Q61301 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnna2Q61301 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnna2Q61301 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnna2Q61301 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnna2Q61301 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnna2Q61301 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnna2Q61301 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnna2Q61301 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnna2Q61301 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnna2Q61301 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnna2Q61301 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ctnna2Q61301 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms