Protein–RNA interactions for Protein: Q61290

Cacna1e, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, mousemouse

Predictions only

Length 2,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1eQ61290 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1eQ61290 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1eQ61290 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1eQ61290 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1eQ61290 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1eQ61290 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1eQ61290 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1eQ61290 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1eQ61290 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1eQ61290 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1eQ61290 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1eQ61290 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cacna1eQ61290 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna1eQ61290 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna1eQ61290 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna1eQ61290 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna1eQ61290 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna1eQ61290 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna1eQ61290 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna1eQ61290 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna1eQ61290 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna1eQ61290 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna1eQ61290 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna1eQ61290 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna1eQ61290 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna1eQ61290 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna1eQ61290 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna1eQ61290 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna1eQ61290 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna1eQ61290 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna1eQ61290 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna1eQ61290 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna1eQ61290 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cacna1eQ61290 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna1eQ61290 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna1eQ61290 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna1eQ61290 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna1eQ61290 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna1eQ61290 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna1eQ61290 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna1eQ61290 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna1eQ61290 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna1eQ61290 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna1eQ61290 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna1eQ61290 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna1eQ61290 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna1eQ61290 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna1eQ61290 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna1eQ61290 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna1eQ61290 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna1eQ61290 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna1eQ61290 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna1eQ61290 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cacna1eQ61290 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna1eQ61290 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna1eQ61290 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna1eQ61290 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna1eQ61290 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna1eQ61290 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna1eQ61290 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna1eQ61290 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna1eQ61290 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna1eQ61290 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna1eQ61290 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna1eQ61290 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna1eQ61290 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cacna1eQ61290 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna1eQ61290 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna1eQ61290 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna1eQ61290 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna1eQ61290 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna1eQ61290 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna1eQ61290 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna1eQ61290 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna1eQ61290 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna1eQ61290 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna1eQ61290 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna1eQ61290 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna1eQ61290 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna1eQ61290 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna1eQ61290 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna1eQ61290 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna1eQ61290 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna1eQ61290 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna1eQ61290 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna1eQ61290 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna1eQ61290 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cacna1eQ61290 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cacna1eQ61290 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacna1eQ61290 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacna1eQ61290 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacna1eQ61290 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacna1eQ61290 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacna1eQ61290 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacna1eQ61290 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacna1eQ61290 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacna1eQ61290 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacna1eQ61290 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacna1eQ61290 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacna1eQ61290 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms