Protein–RNA interactions for Protein: Q60987

Foxg1, Forkhead box protein G1, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxg1Q60987 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Foxg1Q60987 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms