Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf3Q60980 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms