Protein–RNA interactions for Protein: Q60961

Laptm4a, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Laptm4aQ60961 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Laptm4aQ60961 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms