Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Traf3Q60803 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Traf3Q60803 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Traf3Q60803 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Traf3Q60803 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf3Q60803 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf3Q60803 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf3Q60803 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf3Q60803 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf3Q60803 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf3Q60803 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf3Q60803 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf3Q60803 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf3Q60803 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf3Q60803 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf3Q60803 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf3Q60803 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf3Q60803 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf3Q60803 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf3Q60803 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf3Q60803 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Traf3Q60803 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Traf3Q60803 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Traf3Q60803 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Traf3Q60803 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Traf3Q60803 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Traf3Q60803 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Traf3Q60803 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Traf3Q60803 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Traf3Q60803 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Traf3Q60803 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Traf3Q60803 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Traf3Q60803 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Traf3Q60803 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Traf3Q60803 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Traf3Q60803 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Traf3Q60803 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Traf3Q60803 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Traf3Q60803 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Traf3Q60803 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Traf3Q60803 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Traf3Q60803 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Traf3Q60803 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Traf3Q60803 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Traf3Q60803 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Traf3Q60803 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Traf3Q60803 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Traf3Q60803 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Traf3Q60803 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Traf3Q60803 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Traf3Q60803 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Traf3Q60803 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Traf3Q60803 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Traf3Q60803 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Traf3Q60803 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Traf3Q60803 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Traf3Q60803 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Traf3Q60803 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Traf3Q60803 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Traf3Q60803 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Traf3Q60803 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Traf3Q60803 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Traf3Q60803 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Traf3Q60803 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Traf3Q60803 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Traf3Q60803 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Traf3Q60803 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Traf3Q60803 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Traf3Q60803 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Traf3Q60803 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Traf3Q60803 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms