Protein–RNA interactions for Protein: Q60793

Klf4, Krueppel-like factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf4Q60793 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Klf4Q60793 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klf4Q60793 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms