Protein–RNA interactions for Protein: Q60773

Cdkn2d, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor D, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2dQ60773 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdkn2dQ60773 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkn2dQ60773 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms