Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Foxd4Q60688 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms