Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ItgaeQ60677 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ItgaeQ60677 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ItgaeQ60677 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ItgaeQ60677 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ItgaeQ60677 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ItgaeQ60677 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ItgaeQ60677 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ItgaeQ60677 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ItgaeQ60677 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ItgaeQ60677 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ItgaeQ60677 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ItgaeQ60677 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ItgaeQ60677 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ItgaeQ60677 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ItgaeQ60677 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ItgaeQ60677 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ItgaeQ60677 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ItgaeQ60677 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ItgaeQ60677 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ItgaeQ60677 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ItgaeQ60677 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ItgaeQ60677 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ItgaeQ60677 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ItgaeQ60677 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ItgaeQ60677 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ItgaeQ60677 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ItgaeQ60677 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ItgaeQ60677 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ItgaeQ60677 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ItgaeQ60677 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ItgaeQ60677 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ItgaeQ60677 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ItgaeQ60677 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ItgaeQ60677 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ItgaeQ60677 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ItgaeQ60677 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ItgaeQ60677 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ItgaeQ60677 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ItgaeQ60677 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ItgaeQ60677 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ItgaeQ60677 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ItgaeQ60677 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ItgaeQ60677 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ItgaeQ60677 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ItgaeQ60677 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ItgaeQ60677 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ItgaeQ60677 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ItgaeQ60677 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ItgaeQ60677 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ItgaeQ60677 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ItgaeQ60677 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ItgaeQ60677 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ItgaeQ60677 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ItgaeQ60677 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ItgaeQ60677 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ItgaeQ60677 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ItgaeQ60677 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ItgaeQ60677 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ItgaeQ60677 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ItgaeQ60677 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ItgaeQ60677 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ItgaeQ60677 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ItgaeQ60677 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ItgaeQ60677 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ItgaeQ60677 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ItgaeQ60677 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ItgaeQ60677 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ItgaeQ60677 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ItgaeQ60677 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ItgaeQ60677 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ItgaeQ60677 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ItgaeQ60677 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ItgaeQ60677 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ItgaeQ60677 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ItgaeQ60677 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ItgaeQ60677 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ItgaeQ60677 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ItgaeQ60677 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ItgaeQ60677 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ItgaeQ60677 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ItgaeQ60677 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ItgaeQ60677 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ItgaeQ60677 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ItgaeQ60677 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ItgaeQ60677 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ItgaeQ60677 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ItgaeQ60677 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ItgaeQ60677 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ItgaeQ60677 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ItgaeQ60677 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ItgaeQ60677 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ItgaeQ60677 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ItgaeQ60677 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ItgaeQ60677 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ItgaeQ60677 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ItgaeQ60677 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ItgaeQ60677 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ItgaeQ60677 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ItgaeQ60677 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms