Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
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PtprnQ60673 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprnQ60673 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprnQ60673 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
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PtprnQ60673 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprnQ60673 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprnQ60673 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprnQ60673 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprnQ60673 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprnQ60673 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
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PtprnQ60673 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprnQ60673 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprnQ60673 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprnQ60673 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprnQ60673 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprnQ60673 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprnQ60673 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprnQ60673 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PtprnQ60673 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprnQ60673 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprnQ60673 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprnQ60673 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprnQ60673 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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PtprnQ60673 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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PtprnQ60673 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprnQ60673 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprnQ60673 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprnQ60673 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprnQ60673 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprnQ60673 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprnQ60673 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprnQ60673 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprnQ60673 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprnQ60673 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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PtprnQ60673 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PtprnQ60673 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprnQ60673 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprnQ60673 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprnQ60673 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprnQ60673 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprnQ60673 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprnQ60673 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprnQ60673 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprnQ60673 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
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PtprnQ60673 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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PtprnQ60673 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprnQ60673 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprnQ60673 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PtprnQ60673 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
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PtprnQ60673 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprnQ60673 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprnQ60673 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PtprnQ60673 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
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PtprnQ60673 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PtprnQ60673 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
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PtprnQ60673 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PtprnQ60673 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PtprnQ60673 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PtprnQ60673 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PtprnQ60673 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PtprnQ60673 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PtprnQ60673 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PtprnQ60673 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprnQ60673 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprnQ60673 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprnQ60673 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprnQ60673 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprnQ60673 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprnQ60673 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprnQ60673 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprnQ60673 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprnQ60673 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PtprnQ60673 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
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