Protein–RNA interactions for Protein: Q60596

Xrcc1, DNA repair protein XRCC1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc1Q60596 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xrcc1Q60596 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xrcc1Q60596 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xrcc1Q60596 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Xrcc1Q60596 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Xrcc1Q60596 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Xrcc1Q60596 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Xrcc1Q60596 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Xrcc1Q60596 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Xrcc1Q60596 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Xrcc1Q60596 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Xrcc1Q60596 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Xrcc1Q60596 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Xrcc1Q60596 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Xrcc1Q60596 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Xrcc1Q60596 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xrcc1Q60596 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xrcc1Q60596 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xrcc1Q60596 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xrcc1Q60596 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xrcc1Q60596 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xrcc1Q60596 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xrcc1Q60596 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xrcc1Q60596 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xrcc1Q60596 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xrcc1Q60596 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xrcc1Q60596 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xrcc1Q60596 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xrcc1Q60596 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Xrcc1Q60596 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xrcc1Q60596 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Xrcc1Q60596 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xrcc1Q60596 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xrcc1Q60596 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xrcc1Q60596 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xrcc1Q60596 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xrcc1Q60596 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xrcc1Q60596 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xrcc1Q60596 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xrcc1Q60596 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xrcc1Q60596 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xrcc1Q60596 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Xrcc1Q60596 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xrcc1Q60596 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xrcc1Q60596 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Xrcc1Q60596 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Xrcc1Q60596 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xrcc1Q60596 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xrcc1Q60596 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xrcc1Q60596 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xrcc1Q60596 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xrcc1Q60596 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xrcc1Q60596 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xrcc1Q60596 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xrcc1Q60596 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xrcc1Q60596 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xrcc1Q60596 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xrcc1Q60596 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xrcc1Q60596 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xrcc1Q60596 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xrcc1Q60596 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Xrcc1Q60596 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xrcc1Q60596 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xrcc1Q60596 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xrcc1Q60596 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xrcc1Q60596 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xrcc1Q60596 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xrcc1Q60596 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xrcc1Q60596 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xrcc1Q60596 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xrcc1Q60596 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xrcc1Q60596 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xrcc1Q60596 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xrcc1Q60596 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xrcc1Q60596 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xrcc1Q60596 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xrcc1Q60596 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Xrcc1Q60596 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xrcc1Q60596 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xrcc1Q60596 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xrcc1Q60596 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xrcc1Q60596 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xrcc1Q60596 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xrcc1Q60596 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xrcc1Q60596 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xrcc1Q60596 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Xrcc1Q60596 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Xrcc1Q60596 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xrcc1Q60596 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Xrcc1Q60596 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xrcc1Q60596 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xrcc1Q60596 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xrcc1Q60596 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xrcc1Q60596 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xrcc1Q60596 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xrcc1Q60596 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Xrcc1Q60596 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xrcc1Q60596 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xrcc1Q60596 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xrcc1Q60596 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms