Protein–RNA interactions for Protein: Q60519

Sema5b, Semaphorin-5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5bQ60519 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sema5bQ60519 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Sema5bQ60519 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sema5bQ60519 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sema5bQ60519 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sema5bQ60519 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sema5bQ60519 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sema5bQ60519 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sema5bQ60519 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sema5bQ60519 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sema5bQ60519 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sema5bQ60519 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sema5bQ60519 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sema5bQ60519 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sema5bQ60519 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sema5bQ60519 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sema5bQ60519 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Sema5bQ60519 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sema5bQ60519 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sema5bQ60519 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sema5bQ60519 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sema5bQ60519 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sema5bQ60519 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sema5bQ60519 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sema5bQ60519 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sema5bQ60519 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sema5bQ60519 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sema5bQ60519 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sema5bQ60519 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sema5bQ60519 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sema5bQ60519 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sema5bQ60519 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sema5bQ60519 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sema5bQ60519 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sema5bQ60519 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sema5bQ60519 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sema5bQ60519 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sema5bQ60519 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sema5bQ60519 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sema5bQ60519 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sema5bQ60519 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sema5bQ60519 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sema5bQ60519 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sema5bQ60519 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sema5bQ60519 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sema5bQ60519 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sema5bQ60519 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Sema5bQ60519 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sema5bQ60519 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sema5bQ60519 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sema5bQ60519 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sema5bQ60519 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sema5bQ60519 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sema5bQ60519 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sema5bQ60519 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sema5bQ60519 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sema5bQ60519 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sema5bQ60519 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sema5bQ60519 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Sema5bQ60519 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sema5bQ60519 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sema5bQ60519 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sema5bQ60519 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sema5bQ60519 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sema5bQ60519 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sema5bQ60519 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sema5bQ60519 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sema5bQ60519 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sema5bQ60519 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sema5bQ60519 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sema5bQ60519 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sema5bQ60519 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sema5bQ60519 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sema5bQ60519 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sema5bQ60519 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sema5bQ60519 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sema5bQ60519 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sema5bQ60519 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sema5bQ60519 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sema5bQ60519 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Sema5bQ60519 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Sema5bQ60519 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Sema5bQ60519 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Sema5bQ60519 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Sema5bQ60519 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sema5bQ60519 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sema5bQ60519 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sema5bQ60519 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sema5bQ60519 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sema5bQ60519 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sema5bQ60519 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sema5bQ60519 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sema5bQ60519 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sema5bQ60519 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sema5bQ60519 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sema5bQ60519 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sema5bQ60519 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sema5bQ60519 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sema5bQ60519 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sema5bQ60519 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms