Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C3

Scaf1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf1Q5U4C3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Scaf1Q5U4C3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Scaf1Q5U4C3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scaf1Q5U4C3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scaf1Q5U4C3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scaf1Q5U4C3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Scaf1Q5U4C3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scaf1Q5U4C3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scaf1Q5U4C3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scaf1Q5U4C3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Scaf1Q5U4C3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scaf1Q5U4C3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scaf1Q5U4C3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scaf1Q5U4C3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scaf1Q5U4C3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scaf1Q5U4C3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scaf1Q5U4C3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scaf1Q5U4C3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scaf1Q5U4C3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scaf1Q5U4C3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scaf1Q5U4C3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scaf1Q5U4C3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scaf1Q5U4C3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scaf1Q5U4C3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scaf1Q5U4C3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scaf1Q5U4C3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scaf1Q5U4C3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scaf1Q5U4C3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Scaf1Q5U4C3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scaf1Q5U4C3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scaf1Q5U4C3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scaf1Q5U4C3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scaf1Q5U4C3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scaf1Q5U4C3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scaf1Q5U4C3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scaf1Q5U4C3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scaf1Q5U4C3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scaf1Q5U4C3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scaf1Q5U4C3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scaf1Q5U4C3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scaf1Q5U4C3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scaf1Q5U4C3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scaf1Q5U4C3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scaf1Q5U4C3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scaf1Q5U4C3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Scaf1Q5U4C3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scaf1Q5U4C3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Scaf1Q5U4C3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Scaf1Q5U4C3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scaf1Q5U4C3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scaf1Q5U4C3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scaf1Q5U4C3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scaf1Q5U4C3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scaf1Q5U4C3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scaf1Q5U4C3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scaf1Q5U4C3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scaf1Q5U4C3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scaf1Q5U4C3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scaf1Q5U4C3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scaf1Q5U4C3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scaf1Q5U4C3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scaf1Q5U4C3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scaf1Q5U4C3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scaf1Q5U4C3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scaf1Q5U4C3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scaf1Q5U4C3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scaf1Q5U4C3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scaf1Q5U4C3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scaf1Q5U4C3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scaf1Q5U4C3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scaf1Q5U4C3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scaf1Q5U4C3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scaf1Q5U4C3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scaf1Q5U4C3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scaf1Q5U4C3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scaf1Q5U4C3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scaf1Q5U4C3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scaf1Q5U4C3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scaf1Q5U4C3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scaf1Q5U4C3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scaf1Q5U4C3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scaf1Q5U4C3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scaf1Q5U4C3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scaf1Q5U4C3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scaf1Q5U4C3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scaf1Q5U4C3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Scaf1Q5U4C3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scaf1Q5U4C3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scaf1Q5U4C3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scaf1Q5U4C3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scaf1Q5U4C3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scaf1Q5U4C3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scaf1Q5U4C3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scaf1Q5U4C3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Scaf1Q5U4C3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scaf1Q5U4C3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scaf1Q5U4C3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scaf1Q5U4C3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scaf1Q5U4C3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scaf1Q5U4C3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms