Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXY1

Specc1, Cytospin-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1Q5SXY1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Specc1Q5SXY1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Specc1Q5SXY1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Specc1Q5SXY1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Specc1Q5SXY1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Specc1Q5SXY1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Specc1Q5SXY1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Specc1Q5SXY1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Specc1Q5SXY1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Specc1Q5SXY1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Specc1Q5SXY1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Specc1Q5SXY1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Specc1Q5SXY1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Specc1Q5SXY1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Specc1Q5SXY1 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Specc1Q5SXY1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Specc1Q5SXY1 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Specc1Q5SXY1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Specc1Q5SXY1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Specc1Q5SXY1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Specc1Q5SXY1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Specc1Q5SXY1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Specc1Q5SXY1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Specc1Q5SXY1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Specc1Q5SXY1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Specc1Q5SXY1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Specc1Q5SXY1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Specc1Q5SXY1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Specc1Q5SXY1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Specc1Q5SXY1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Specc1Q5SXY1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Specc1Q5SXY1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms