Protein–RNA interactions for Protein: Q5SX40

Myh1, Myosin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh1Q5SX40 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Myh1Q5SX40 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Myh1Q5SX40 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Myh1Q5SX40 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Myh1Q5SX40 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Myh1Q5SX40 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Myh1Q5SX40 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Myh1Q5SX40 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Myh1Q5SX40 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Myh1Q5SX40 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Myh1Q5SX40 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Myh1Q5SX40 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Myh1Q5SX40 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Myh1Q5SX40 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Myh1Q5SX40 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Myh1Q5SX40 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Myh1Q5SX40 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Myh1Q5SX40 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Myh1Q5SX40 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Myh1Q5SX40 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Myh1Q5SX40 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Myh1Q5SX40 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Myh1Q5SX40 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Myh1Q5SX40 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Myh1Q5SX40 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Myh1Q5SX40 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Myh1Q5SX40 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Myh1Q5SX40 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Myh1Q5SX40 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Myh1Q5SX40 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Myh1Q5SX40 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Myh1Q5SX40 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Myh1Q5SX40 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Myh1Q5SX40 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Myh1Q5SX40 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Myh1Q5SX40 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Myh1Q5SX40 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Myh1Q5SX40 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Myh1Q5SX40 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Myh1Q5SX40 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Myh1Q5SX40 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Myh1Q5SX40 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Myh1Q5SX40 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Myh1Q5SX40 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Myh1Q5SX40 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Myh1Q5SX40 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Myh1Q5SX40 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Myh1Q5SX40 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Myh1Q5SX40 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Myh1Q5SX40 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Myh1Q5SX40 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Myh1Q5SX40 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Myh1Q5SX40 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Myh1Q5SX40 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Myh1Q5SX40 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Myh1Q5SX40 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Myh1Q5SX40 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Myh1Q5SX40 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Myh1Q5SX40 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Myh1Q5SX40 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Myh1Q5SX40 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Myh1Q5SX40 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Myh1Q5SX40 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Myh1Q5SX40 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Myh1Q5SX40 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Myh1Q5SX40 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Myh1Q5SX40 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Myh1Q5SX40 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Myh1Q5SX40 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Myh1Q5SX40 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Myh1Q5SX40 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Myh1Q5SX40 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Myh1Q5SX40 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Myh1Q5SX40 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Myh1Q5SX40 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Myh1Q5SX40 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Myh1Q5SX40 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Myh1Q5SX40 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Myh1Q5SX40 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Myh1Q5SX40 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Myh1Q5SX40 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Myh1Q5SX40 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Myh1Q5SX40 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Myh1Q5SX40 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Myh1Q5SX40 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Myh1Q5SX40 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Myh1Q5SX40 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Myh1Q5SX40 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Myh1Q5SX40 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Myh1Q5SX40 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Myh1Q5SX40 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Myh1Q5SX40 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Myh1Q5SX40 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Myh1Q5SX40 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Myh1Q5SX40 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Myh1Q5SX40 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Myh1Q5SX40 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Myh1Q5SX40 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Myh1Q5SX40 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Myh1Q5SX40 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms