Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ankrd40Q5SUE8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ankrd40Q5SUE8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ankrd40Q5SUE8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ankrd40Q5SUE8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ankrd40Q5SUE8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ankrd40Q5SUE8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ankrd40Q5SUE8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ankrd40Q5SUE8 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ankrd40Q5SUE8 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ankrd40Q5SUE8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ankrd40Q5SUE8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ankrd40Q5SUE8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ankrd40Q5SUE8 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ankrd40Q5SUE8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ankrd40Q5SUE8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ankrd40Q5SUE8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ankrd40Q5SUE8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ankrd40Q5SUE8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ankrd40Q5SUE8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ankrd40Q5SUE8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ankrd40Q5SUE8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ankrd40Q5SUE8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ankrd40Q5SUE8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ankrd40Q5SUE8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ankrd40Q5SUE8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ankrd40Q5SUE8 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ankrd40Q5SUE8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ankrd40Q5SUE8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ankrd40Q5SUE8 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ankrd40Q5SUE8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ankrd40Q5SUE8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ankrd40Q5SUE8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ankrd40Q5SUE8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ankrd40Q5SUE8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ankrd40Q5SUE8 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ankrd40Q5SUE8 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ankrd40Q5SUE8 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ankrd40Q5SUE8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ankrd40Q5SUE8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ankrd40Q5SUE8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ankrd40Q5SUE8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ankrd40Q5SUE8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ankrd40Q5SUE8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ankrd40Q5SUE8 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ankrd40Q5SUE8 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ankrd40Q5SUE8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ankrd40Q5SUE8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ankrd40Q5SUE8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ankrd40Q5SUE8 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ankrd40Q5SUE8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ankrd40Q5SUE8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ankrd40Q5SUE8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ankrd40Q5SUE8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ankrd40Q5SUE8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ankrd40Q5SUE8 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ankrd40Q5SUE8 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ankrd40Q5SUE8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ankrd40Q5SUE8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ankrd40Q5SUE8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ankrd40Q5SUE8 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ankrd40Q5SUE8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ankrd40Q5SUE8 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ankrd40Q5SUE8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ankrd40Q5SUE8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ankrd40Q5SUE8 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ankrd40Q5SUE8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ankrd40Q5SUE8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ankrd40Q5SUE8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ankrd40Q5SUE8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ankrd40Q5SUE8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ankrd40Q5SUE8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms