Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUC9

Sco1, Protein SCO1 homolog, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sco1Q5SUC9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sco1Q5SUC9 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms