Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Fam71bQ5STT6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam71bQ5STT6 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms