Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPX3

Rnf215, RING finger protein 215, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf215Q5SPX3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rnf215Q5SPX3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf215Q5SPX3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms