Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGU6

Rtp3, Receptor-transporting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp3Q5QGU6 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rtp3Q5QGU6 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms