Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU02

Usp22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp22Q5DU02 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp22Q5DU02 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp22Q5DU02 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms